Für den Schutz gegen ein hängenbleiben des Programm gibt es den Watchdog timer. Einfach mal was darüber nachlesen.

Wenn es noch sicherer sein soll, müßte man die Treiber so bauen, dass sie bei zu lange Konstantem Signal einfach Ausschalten. Das würde sich hier wohl für die 3 "GND Select" Kanäle anbieten.