Wenn du schon ein *.hex File hast für deinen Mega32
Connect, in Main muss der richtige Kontroller ausgewählt sein
dann Programm, in Flash das *.hex File auswählen, dann Programm
sollte es ein *.eep File auch geben dann das gleiche bei EEPROM nochmal mit *.eep.
Dann der Reiter Fuses, die Fuse werden automatisch ausgelesen, den Haken bei JTAG wegnehmen, sonst sind einige Pin an PortC blockiert.
Weitere Fuseeinstellungen siehe hier: www.engbedded.com/fusecalc/