das STK500 kann auch HV programmieren (siehe STK500 Manual).

Der Programmer ist im AVR-Studio unter Tools->Program AVR->Connect...
Hier gleich der erste Eintrag "STK500 or AVRISP", noch den richtigen Port auswählen und dann bist du im Programmer.
Der 3. und 4. Tab von Links sind dann jeweils die Fuse- und Lockbits.
Genauer gehts nicht

mfg