Die Mux Beschaltung schaut IO aus, wobei ich nicht ins Datenblatt geschaut habe. Auf jeden Fall müsste Der Multiplexer umschalten wenn von 0 auf 1
und umgekehrt. Vorsichtshalber könnte man noch einen Pull up in die VCC
Leitung von JP9 einplanen, wenn man den nicht benötigt kann der leicht durch
einen 0R ersetzt werden.
Da du den Reset ja nicht umschaltest werden beim Prog. beide Controller
Resetet. Da dann ja beide Pull up Widerstände parallel geschaltet sind
sollten diese nicht kleiner als 10k sein.

Gruß

Neutro