Die PWM Ausgänge die an einem Timer hängen sind in der Regel so gekoppelt, das sie bei gleichen Tastverhaltnis syncron laufen. Die PWM Signale vom anderen Timer kann man mit etwas Aufwand in der Phase verschieben, oder ggf. auch mit anderer Frequenz haben.

Die Invertierten PWM Ausgänge hat der Mega32 wohl nicht. Bei einigen andernen Controllern gibt es aber so etwas.