Bei Schaltreglern muß man etwas aufpassen mit der Masseführung. Sonst hat man mehr Störungen drauf als ohnehin schon mit Schaltreglern.
Wenn man damit empfindliche Schaltungen betreiben will, sollte man besser linearregler nehmen, für die 5 V eventuell auch erst einen Schaltregler auf etwa 6 oder 8 V und dann einen LM2950 oder 7805 dahinter.

Alternativ auch einfach nur einen extra 7805 dazu als extra 3. Ausgang für empfindliche Schaltugngen. Der kann dann aber nicht so viel Strom ab.

Edit:
Wenn der Trafo 2 Getrennte zweige hat, kann man die fast wie 2 getrennt Trafos sehen. Dann braucht man auch keine gemeinsame Masse für beide Hälften.