Der für dich wohl wichtigste Unterschied ist die Gehäuseform: der HC18 hat nen großes, der HC49U-S ein flacheres Gehäuse. Da kein Preisunterschied, verwende ich den HC49U-S. Den kann man beim Mega16/32 gut unter dem IC-Sockel packen.
Kondensator ist relativ unkritisch, aber nimm eher die 22p. Der theoretisch "richtige" Wert ist nicht die CL-Angabe, sondern ergibt sich über ne Formel aus dem Datenblatt des AVR.