Welche Interrupts sollten sich da beeinflussen?

Das kann man alles mit einem Interrupt erschlagen. Mit einem Quarz sollte bei 3 PWMs auch die Abtastrate in einem brauchbaren Rahmen bleiben, zumindest war es bei mir mit C so - wie das bei Bascom aussieht weiß ich nicht, müsste aber auch klappen.

Du musst dann in der Interrupt-Routine eben alle Ports je nach Konfiguration an- und abschalten. Das Beispiel für Software-PWM im Wiki sollte dir weiterhelfen, den Rest kann man sich dazzureimen.