Durch das dauernde an/aus ändert sich auch die Spannung an der LED: Etwa 1,5 V wenn ein und fast 0 V wenn aus. Der Mittelwert der Spannung ist für die LED eher unwesentlich, wichtiger ist der Mittelwert des Stroms.

250 mA für eine IR LED sind eine Menge Strom. Da wird auch der Widerstand schon richtig heiß !

Eventuell wäre es besser mehrere LEDs in Reihe zu nehmen, und dafür weniger Strom.