Durch ändern der Fuses kann sich die Frequenz vermutlich etwas verändern. Allerdings wird das kaum nutzbar sein, denn man hat ja nur 1-3 Stellungen die für einen Quarz gehen.

Wie schon von fhs geschrieben wird eine Trimmkondensator zu trimmen gehen, entweder parallel zum Quarz oder bei einem der 22 pF Kondensatoren.

Zum Abgleich der Frequenz wäre vermutlich so etwas wie die Horizontalfrequenz des Fernsehsignals besser geeignet als 10 Stunden auf den Funkwecker zu warten. Als einfachen Test könnte man z.B. den AVR ein 15625 Hz Signal erzeugen lassen (z.B. als PWM) und die Schwebingen ansehen. Besser wäre es natürlich den AVR das 15625 Hz signal messen zu lassen und ausgeben.