Hi!
Als Rail-to-Rail OpAmp wäre z.B. ein MAX492, OPA347 oder TS912 geeignet. Die gibt es auch bei Reichelt zu kaufen (der MAX ist aber etwas teuer).

Ich nehme mal an, dass der Controller keine Verbindung nach draußen hat. Dann sollte es kein Problem darstellen wenn die Controller-Masse mit der "Power"-Masse an einer einzigen Stelle verbunden wird.
Wenn man die Massen nur an einer Stelle verbindet, dann werden auch keine/kaum Störungen übertragen.

MfG
Basti