Soweit ich weisz muesste das leicht im negativen Bereich sein, damit TTL Bausteine funktionieren.
Nein. Für TTL muss der Low-Pegel <0,8V sein.

aber beim Low Pegel genau 0v hat (egal ob ich Volt zwischen Pin und + oder Pin und - messe)
Wenn du sowohl zwischen Pin und VCC 0 Volt misst, wie auch zwischen Pin und GND, dann ist der Pin hochohmig, also wahrscheinlich als Eingang konfiguriert. Ist vermutlich ein Fehler in deinem Programm.