Also wenn du die Phasen U, V und W nennst, dann präge zuerst den Impuls:

Highside U, Lowside V und dann Highside V und Lowside U ein.

Dann sollte sich das Moment ziemlich gut aufheben.

2ms erscheinen mir etwas lang.
Welchen Motor verwendest du denn ? Also welche Induktivität, Widerstand und welchen Shunt ?
Die normalen Shunts haben ja nur einige Milliohm. Auch wenn der Strom recht hoch wird, kann man da nicht viel messen. Der Spannungsabfall muss dann verstärkt werden. Außerdem kann es sein, je nachdem wo sich der Shunt in der Schaltung befindet, dass kaum Strom durch diesen fließt, sondern nur Blindströme über den Zwischenkreiskondensator. Versuch doch mal, direkt den Shunt in eine Phase zu legen.