Ich habe einen Mega32 seit mehreren Monat im Dauerbetrieb.
Der Mega selbst ist vermutlich weniger das Problem dabei.
Dann eher die Schaltung und Programmierung.

Kühlen ist nicht wirklich sinnvoll. Da der Mega auch ein beschäftigter Mega mit 16 Mhz im Normalfall nicht warm wird.

Für einen sicheren Dauerbetrieb würde ich den Mega aber abschirmen.
Also in ein Gehäuse setzen das Störstrahlungen usw. dämpft.
Denn solche Megas flippen in der nähe von Handys oder anderen hochfrequenten Strahlungen förmlich aus