Nein, es sind zu wenig Impulse um das auszugleichen. Die einfachste Möglichkeit wäre unterschiedliche PWM-Werte zur Ansteuerung nehmen, wobei du die Differenz einfach durch ein paar Test´s herausfindest. Wenn er gerade fährt, hast du die richtige Differenz gefunden.
Ist zwar keine optimale Sache, aber für den Hausgebrauch reicht das eigentlich.