Ich kann EMC² auch nur empfehlen.

In Kombination mit Eagle und dem ulp pcb-gcode funktioniert das perfekt.
Mit BoCNC hab ich auch schon ein bisschen rumexperimentiert, das lässt sich auch gut vereinen.

EMC hat 2 große Vorteile: Die Pinbelegung ist vollkommen flexibel
Und zweitens: Linux gibts mit Echtzeitkernel