Mensch die Idee ist genial, so einen billigen Alukoffer als Gehäuse zu verwenden. Das werde ich bei Gelegenheit auch mal machen, wenn du erlaubst

Durch das Push-Pull-Pusten sollte die mittlere Karte auch gekühlt werden. Von daher dürfte es einigermaßen gehen.
Ich würde aber das Silikon zwischen L298 und Kühlkörper wegmachen.
Isolieren musst du da eigentlich nicht, und das blockiert nur den Wärmefluss.