Du hast dir da einen Spannungsteiler gebaut.
I=(5V-Uled)/2000Ohm
Und die Spannung ist dann somit U=5V-I*1000Ohm
Klar dass da keine 5V rauskommen können. Also weg mit dem Parallelzweig.
Wenn du wirklich die Diode brauchst dann kannst du sie ja, getrennt über einen zweiten Transistor, dranhängen.