Mh also wenn du die möglichkeit hast, eine Metallscheibe+Elektromagnet anzubringen, dann würde ich dir einfach zu einer Kombination raten. Ich weiß nicht wie kompakt es sein muss. Für Modellflugzeuge gibt es Bremsen, die so flach sind, dass sie in die Radkappe integriert werden können.
Zuerst würde ich aus einem Stahl- oder Kupferblech eine Scheibe schneiden, die stabil genug ist. Bei der Wirbelstrombremse ist die Leitfähigkeit wichtig.
Dann kannst du einen Eisenkern nehmen, wie du ihn brauchst, und eine Spule drauf wickeln. Bei der Auswahl des Kupferlackdrahtes musst du abschätzen, wieviele Windungen und wieviel Ampere du willst. Je stärker das Magnetfeld, umso größer der Effekt.
Wenn du den Eisenkern selber baust, kannst du ihn wunderbar anpassen.

Zusätzlich würde ich einfach noch die andere Methode nehmen. Bin mir aber nicht sicher, was effektiver ist, ob du einfach beide Spulen ansteuerst, oder mit einem Schalter diese kurzschließt (Generatorbetrieb). Ich würde beides probieren, geht mit wenig Aufwand, aber achte auf die Ströme und damit die Temperaturen, sonst kannst du den Motor oder die Elektronik beschädigen.
Der Vorteil liegt natürlich darin, dass diese Arten verschleißfrei sind. Du kannst noch eine mechanische Bremse einbauen, eine Scheibenbremse oder einfache Bremsbacken. Kommt drauf an, wie groß der Diskus ist, vielleicht kannst du Fahrradzubehör adaptieren.