Das Problem ist schon die Ausnahme, denn normal ist bei Netzteilen der Minus Pols mit PE verbunden, oder es gibt gar keine Verbindung zu PE. Ganz entfernen sollte (darf) man den PE Anschluß nicht. Der Anschluß ist aus Sicherheitsgründen da, höchstens auf den anderen Pol umbauen, wenn man genau weiss was man macht.
Die Alternative wäre ein typisches Steckernetzgerät das keine PE Verbindung hat (SK II).

Eine andere Alternative wäre ein Programmierer mit glavanischer Trennung zum PC.

Das die Schaltung nur geht wenn man das Gehäuse berührt, spricht jetzt für eine Fehlende Masserverbindung zwischen dem PC und der Schaltung.