Man kann den Komperator Eingang mit dem MUX vom AD-wandler auch auf die AD-Eingänge umschalten. Wenn man einen Mega88 nimmt liegt die interne Ref bei ca. 1.2 V und wäre ideal als Schaltschwelle.
Sonst wäre halt der AD Wandler. Da es nur um eine digitales Signal geht könnte der AD Wandler auch recht schnell laufen (13 us) Wandlungszeit, eventuell sogar noch schneller.