USB-Wandler machen nach meiner Erfahrung und dem was man so liest immer Probleme. Mein LPT-Dongle funktioniert immer. Ich würde dir zu einem USB AVR-ISP raten, so wie hier www.ullihome.de/index.php/Hauptseite#USB_AVR-ISP
Gibt es glaube ich auch als Bausatz. Das ist sicher handlicher als ein extra PC. Schau aber nach wie es da mit Bascom aussieht, mit dem AVR-Studio funktioniert das bestens. Das sollte nciht mehr als 25€ kosten.

Nachtrag: Leg an XTAL1 des Mega16 einen ext.Takt an, vieleicht lässt er sich so wiederbeleben.