Na ja, man kann den Reset bei manchen AVR´s auch abschalten in den Fusebits. Aber beim m32 ist das m.W. nicht der Fall.

Es KÖNNTE trotzdem sein, dass Du ein Problem mit den Fuses hast (doc, Seite 44):
1. When the BOOTRST fuse is programmed, the device will jump to the Boot Loader address at reset, see “Boot Loader Support – Read-While-Write Self-Programming” on page 244.

... oder etwas anderes