Meine Erfahrung ist, dass man die Pins normal verwenden kann, aber LEDs sollte man nicht an diese Pins anschließen. Die ziehen immer zu viel Strom, sodass der Programmer den µC nicht mehr erkennt.
Aber wie gesagt, das ist nur mein Erfahrung, andere haben andere Erfahrungen und raten davon in jedem Fall ab.

mfg,
jon