Okay,

.hex liefert der WINAVR mit dem original makefile "frei Haus". Das Problem ist die Übertragung zum µC. Per RS232 brauchst Du diese ganzen Tools nicht unbedingt. Hyperterminal tut es normalerweise auch. Entweder geht die Datei mit "text senden" auf die Reise über das Kabel, oder der Bootlader versteht eines der angebotenen Protokolle (XMODEM, YMODEM, ZMODEM, ...) und dann läuft das per "datei senden". Du müßtest Dich mal durch die Doku zum Bootlader durchgraben um rauszufinden was er kann und was nicht.

Gruß H.A.R.R.Y.