Hi,
Wenn es darum geht, mit Linux als Entwicklungssystem einen Mikrocontroller zu programmieren, dann geht das mit (fast) jeden Controller.
Die 8-Bit AVRs sind dabei die beliebtesten. Dafür wirst Du wohl am meisten Hilfe hier bekommen.
Unter Linux benötigst Du dann GCC als Compiler und avrdude zum flashen.
Allerdings das ganze in C ohne ++. C++ benötigt allgemein etwas größere Mikrocontroller (z.B. ARM), da der Speicherbedarf hier doch erheblich ist.

Gruß
pctoaster