Bei Kleinserien ist das äußerst nervig... ;o)
Die Lösung ist sehr einfach,
man nehme avrdude, schreibt ein Miniskipt in dem auf Knopfdruck
1. Fuses gesetzt werden
2. Programm übertragen wird
3. EEprom beschrieben wird
und flucht, daß man den Programmierstecker ständig von Platine zu Platine umstecken muß.

Gruß Sebastian