Die Ausgänge sind im Prinzip gleich gut geeignet. Welchen du nimmst, hängt bloß davon ab, welchen Timer du gerne verwenden würdest.
OC1A/B "gehören" beide zu Timer1, OC2 zu Timer2.
Die Auflösung des PWM kannst du einstellen(ich glaube 8-10 bit).
Hast du eigentlich das Datenblatt zum Mega8? Da steht das alles ziemlich genau drin(wenn auch etwas verteilt).