Wenn ich das richtig verstanden habe, dann geht es nur um das "Flashen" des AVRs... also das schreiben bein Neuprogrammieren des Chips. Das eigentliche Basic-Programm greift nur lesend auf den Speicher zu.
Das EEPROM kann ca. 100.000 Mal (hab ich das richtig in erinnerung?) beschrieben werden... das schafft kein normaler Mensch bei üblicher Verwendung. Die Schreibzugriffe aus dem Basic-Programm sollten (wenn sie stattfinden) allerdings begrenzt werden.

Gruß,
SIGINT