Irgendwas musst du in der Tat falschmachen. Das sollte eigentlich genauso funktionieren, wie du erwartest hattest. Wenn du nur die zum Auslesen nötigen Register am ADC gesetzt hast und dein ADC nicht kaput ist(den kriegt man eigentlich nur mit hohen Spannungen kaput.), muss eigentlich in deiner Schaltung was nicht in Ordnung sein.
Ist das Ergebnis zuverlässig reproduzierbar?