Wieviel Strom zieht denn deine IRLED?
Du kannst maximal 20-25mA an einem PortPin ziehen. Vielleicht ist dein RV falsch bemessen und deshalb flackert die IRLED, da die Spannung zusammenbricht.

Gruß RobberS

PS: Vielleicht noch den BOR überprüfen, da du mit 3V arbeitest!