Hallo stochri,

Der RP6 Bootloader kümmert sich zwar auch schon um die grundlegenden Sachen wie Portrichtung etc., aber nicht um die genauen Einstellungen.
Das muss noch mit ins Programm rein - sonst wird einiges nicht wirklich funktionieren. Die Hardware ist beim RP6 komplett anders als beim ASURO.

Die ganzen Timer/PWM Einstellungen kannst Du daher natürlich nicht vom ASURO übernehmen!
Da solltest Du Dir mal die Init Routine von der RP6Library anschauen!

MfG,
SlyD