Ich glaube, das ist ein Denkfehler.

Der Timer zählt immer unbeirrbar weiter. Wenn du einen 8-Bit Timer mit 20Hz ticken läßt, dann mußte er alle 12,8 Sekunden beim Überlauf den Interrupt auslösen, wobei er dann weiterzählt.
Deine LED sollte also eigentlich 10,8 Sekunden aus sein, dann 2 Sekunden an u.s.w.

Wobei man sich leicht mal vertut ist die Berechnung des Interruptintervalls aus Taktfrequenz, Prescaler und der Bittiefe des Timers.
Kannst ja mal deinen Quellcode einstellen, vielleicht finden wir dann des Rätsels lösung

Gruß MeckPommER