Hallo, es ist ein bekanntes Problem mit den alten AT90* und zwar wird gelegentlich Müll im EEPROM geschrieben, wenn Die Versorgungspannung beim Abschalten in einen kritischen Bereich fällt.
Lösung ist ein Brown out Detektor.
Schau mal auf dieser Seite unter AVRProjekte/Das USB-LCD
ziemlich weit unten "Vorsicht Fehler beim AT90S2313 !", da wird eine Lösung vorgeschlagen.
Leider kann ich keinen direkten Link Posten, das findest Du schon

Gruß Sebastian