DDRX = 0x00; //gesamter Port als Eingang
DDRX = ~_BV(PX1) & ~_BV(PX2); //nur PX1 und PX2 zwei als Eingänge
DDRX &= ~_BV(PX5); //nur PX5 als Eingang

analog das Aktivieren der Pull-Ups:
PINX = 0x00;
PINX = ~_BV(PX1) & ~_BV(PX2);
usw.

Ich empfehle dir das durcharbeiten der Links auf dieser Seite, sie verweisen auf einige nützliche Tutorials.

Gruß, Alex