Hallo,
wie wärs, wenn du ins EEPROM (oder in ein Arbeitsgerister, die werden soviel ich weiß bei einem Reset nicht gelöscht) immer den aktuellen Laufmodus schreibst und den taster an Reset anschließt.
Wenn der AVR resettet liest du den Laufmodus aus und schreibst den neuen Laufmodus ins EEPROM/in ein Registger

Viele Grüße,
Johannes