Nachdem dein Zähler time2 den wert 4 erreicht hat wird der USART gestartet. Da Du aber in dieser Routine weder den Zähler time1 noch den zähler time2 zurücksetzt wird der USART durch die Comparematch Routine ständig getriggert und ständig der Wert 0 ausgegeben.
Ich hab auch noch ein paar andere Sachen umgestrickt von wegen Register sichern. Das nicht- sichern scheint ja in Mode zu kommen.
Den Fehler hab ich halt wieder mal mit dem Simulator vom AVR Studio gefunden - hat also doch seinen Sinn das Teil.

Code:
 .include "m8def.inc"
.def temp = r16
.def counts = r17
.def kmh = r18
.def time1 = r21
.def time2 = r22
.equ CLOCK = 16000000
.equ BAUD = 9600
.equ UBRRVAL = CLOCK/(BAUD*16)-1#

.org 0x000
   rjmp main
.org INT0addr
   rjmp int0_handler
.org OC1Aaddr
    rjmp timer1_compare

main:
   ldi temp, LOW(RAMEND)
   out SPL, temp
   ldi temp, HIGH(RAMEND)
   out SPH, temp
      
   ldi temp, LOW(UBRRVAL)
   out UBRRL, temp
   ldi temp, HIGH (UBRRVAL)
   out UBRRH, temp

   ldi temp, high(40000-1)
   out OCR1AH, temp
   ldi temp, low(40000-1)
   out OCR1AL, temp
   
   ldi temp, ( 1 << WGM12 ) | ( 1 << CS00 )
    out TCCR1B, temp
 
    ldi temp, 1 << OCIE1A  ; OCIE1A: Interrupt bei Timer Compare
    out TIMSK, temp   

   ldi temp, (1<<URSEL)|(3<<UCSZ0)
   out UCSRC, temp
   
   ldi temp, 0x00
   out DDRD, temp
   ;ldi temp, 0xFF
   ;out PORTD, temp

   ldi temp, 0b00001010  ; INT0 und INT1 konfigurieren
   out MCUCR, temp

   ldi temp, 0b11000000  ; INT0 und INT1 aktivieren
   out GICR, temp

   sbi UCSRB,TXEN
   sei

loop: rjmp loop

int0_handler:
   push temp
   in temp,sreg
   push temp
   ldi temp, 1
   add counts, temp
   pop temp
   out sreg,temp
   pop temp
   reti

timer1_compare:
   push temp
   in temp,sreg
   push temp
      
   cpi time1, 100
   breq time2u
   brne time1w

time2u:
   clr time1
   cpi time2, 4
   breq rechnekmh
   brne time2w

time1w:
   inc time1
   rjmp outint0

time2w:
   inc time2
   rjmp outint0


rechnekmh:
   clr time2
   clr kmh
   mov kmh, counts
   lsl kmh
   clr counts
   rjmp uartu

uartu:
   sbis UCSRA, UDRE
   rjmp uartu
   out UDR, kmh

outint0:
	pop temp
	out sreg,temp
	pop temp
	reti