Ich tippe ebenfalls sehr auf Störungen durch die Stromspitzen der PWM-Signale. Die übertragen sich über deine Bordspannung wunderschön auf deine C-Control und die verträgt das nicht besonders gut. Eben dein Phämomen. Das kann man nur wie von Die Hard beschrieben lösen wenn es ein Aufbau bedingter Fehler ist oder durch Entstörung der Versorgung. Also LC-Glied zur C-Control in der Versorgung.

Grüsse Wolfgang