Hallo nochmals, ich denke ich konnte endlich das Problem lösen...
Nachdem ich die Register in der Hauptschleife nach den Registern in der "onADC" ISR (r27 bzw r26) benannt habe funktioniert es endlich.
mainloop: wdr
out OCR1AH,r27
out OCR1AL,r26
rjmp mainloop ; Sprung zum Beginn der Hauptprogrammschleife

Es gibt sicher eine bessere Lösung für das Problem.
Ich würde mich über weitere Kommentare und Tipps freuen!

Gruß Vashan