Der Ladestrom zum Goldcap wird nicht allzu groß, weil Goldcaps einen recht hohen ESR haben. In einer meiner Schaltungen sitzt ein 1F Goldcap. Nach Entladen des GC und neuerlichem anschliessen an VCC fliessen nicht mehr als kurzzeitig 300 mA. Der Strom geht innerhalb weniger Sekunden auf 100mA zurück. Ein L05 ist aber trotzdem zu klein. Wegen des hohen ESR der GC ist ein Reihenwiderstand IMHO nicht so der Brüller.

Mit der Schaltung überlebt der µC etwa 3-4 Stunden (Timer2 aktiv) oder 24 Stunden (Timer2 nicht aktiv). Controller ist ein ATmega88V, der geht bis 1.8V runter.

Evtl hast du die Möglichkeit ein kleineres U_REF zu verwenden? Dann könntest du die Referenzspannung über eine Referenzdiode machen, oder Z-Diode oder über eine der internen Referenzen. Allerdings verlierst du dann Genauigkeit bei der ADC-Messung. In dem Falle würde die Diode zwischen GC und Ausgangs-C sitzen. Mit der Schaltung von oben hast du wieder das Problem, daß U_REF nicht die vollen 5V sieht sondern wieder hinter einer Diode sitzt.