Also,
ich hab mir jetzt den MCS-Bootloader mal kurz angesehen:
Die Bootloader.exe benötigt bei mir keine BAS sondern eine BIN(är) Datei...
vielleicht hast du ja ne andere Version. Ich hab auf die Schnelle leider kein Programm gefunden, daß eine HEX-Datei versteht.
Wenn du jetzt hingehst und den Bootloader auf dem AVR durch einen anderen ersetzt kannst du das Board nicht mehr in Bascom nutzen... du brauchst dann ein anderes Programm um dein Benutzerprogramm in den AVR zu übertragen.
Hier gibts eine Liste mit Bootloadern:
http://www.mikrocontroller.net/articles/Bootloader
Ich hab bis jetzt aber nur den HEX-Bootloader (siehe Link im ersten Artikel)
getestet.... schau dir also die anderen erstmal an.

Gruß,
SIGINT