Wenn du eine Lampe über PWM regelst, kannst du für die Zeit der Temperaturmessung die PWM-Ausgabe stoppen.

Die Messung sollte kurz genug sein, um keine Helligkeitsschwankung zu bemerken.

Alternativ kannst du parallel zum Temperaturwiderstand einen entsprechend dimensionierten Kondensator schalten, der die PWM-Frequenzen unterdrückt (Tiefpassfilter).