Mit den Jumperns kannst Du die Taster, Leds, Summer, EEPROM und RS232 vom AVR trennen. Das ist nötig wenn Du die Pins mit was anderem belegen willst. Auf das Beschreiben vom AVR haben die Jumper keinen einfluss. (Das geht auch aus dem Schlatplan hervor dem es zum Board dazugibt.)

Ein auslesen sollte auch mit nem leeren(neuem) Atmel funktionieren!