Du musst den AVR-Button nehmen. Sollte eine Meldung kommen, dass kein Programmiergerät gefunden wird, musst du dort noch den AVR ISP mkII und ggf. den Anschluss auswählen. Anschließend bist du ja in dem Programm, wo du den AVR auch löschen und wo du auch die Fuses setzen kannst. Dort besteht auch die Möglichkeit ein Hex-File auszuwählen und zu flashen...

Hast du denn bei der Installation vom AVR-Studio auch die USB-Treiber mit installiert?

Gruß, Bernd