Hallo,

das Problem kenne ich nicht. Ich nehme an, Du hast den Programmer am USB-Port laufen. Hast Du das Kommando auf der Shell probiert? Falls es dort auch nicht geht, probier mal dieses Kommando:

avrdude -p m16 -c avrispv2 -P USB -u -U flash:r:/home/cybrix/atmega16.hex:i

Geht das vielleicht?

viele Grüße,
cadManiac