Ich nehme an du hast im PonyProg auch im Setup "Calibration" durchgeführt und für das Serielle auch umgestellt. Das Kabel kontrolliert, dann sollte es eigentlich funktionieren. Ich habe mir erst kürzlich genau so ein Kabel gemacht und es hat auf Anhieb funktioniert. Das wird dir nicht viel helfen, aber es ist meiner Ansicht nach Nachbausicher.
Das es an der Frequenz liegt glaube ich nicht, ein neuer Mega8 hat intern 1MHz takt und lässt sich auf Anhieb proggen.