Hi,
die parallelität der beiden Führungen kannst Du relativ einfach überprufen/einstellen.
Du baust deinen Schlitten mit nur einseitiger Führung. Darauf setzt Du eine Meßuhr und tastest den Abstand der anderen ab. Geht auf 1/100 mm genau, vorausgesetzt Du hast die bereits eingehänge Führung entsprechend gebaut z.B. Linearlager.

Dann die gegenüberliegende Lagerung befestigen.

Gruß, Klingon77