Du musst im Schaltplan so vorgehen als ob Du einen neuen Schaltplan entworfen hast. Bei der Zuordnung der Bauteile zu den Symbolen wird aber nur das neue Symbol ohne Zuordnung sein. Das wird dann ergänzt und gespeichert.
Danach öffnest Du "Pcbnew" und lädst die Netzdatei erneut. Dann taucht das Bauteil auf und Du kannst es plazieren.
Schau mal ob das so auf die Schnelle geschrieben funktioniert.

Grüße!