Tu dir den Gefallen und vergiss die Lösung mit den 74HC244. Besser ist sowas: http://www.mikrocontroller-projekte....rogrammer.html
Um den zu bauen, muss man allerdings schon nen AVR programmieren können, aber du hast ja das STK. Diser ISP wird über die serielle Schnittstelle angeschlossen. Du müsstest also zwei serielle Schnittstellen über das Zuleitungskabel führen, also zweimal RX, zweimal TX und Masse. Dann könntest du sogar jedes Signal zusammen mit Masse auf ein separates Adernpaar legen, dann ist di Störsicherheit noch besser und es dürften einige Meter drin sein. Und von ISP, der bei "Mainboard" sitzt, dann MOSI und co. weiterführen.