Sorry, hast vollkommen Recht. Es sind natürlich 90° und nicht 180. Wenn ein Fensterchen von der Codierscheibe durch die Lichtschranke läuft, entstehen vier Schaltflanken und zwar zwei positive und zwei Negative. Wenn du den Decoder-Chip im "x4-Mode" betreibst, dann dann erzeugt er aus jeder der vier Schaltflanken einen Zählimpuls, also vier Zählimpulse pro Fenster im Mausrädchen. Da kann man die Position schon sehr genau erfassen.

Wenn trotzdem nach einigen Metern Abweichungen entstehen, dann wird es sicherlich nicht an der Elektronik liegen, eher an der Mechanik. Wenn du die Bewegung z.B. mit der Mauskugel erfassen willst, kann schon mal was rutschen oder so. Außerdem hat die Kugel relativ viel Spiel.
@RobotXY: Vielleicht solltest du mal überlegen, das Mausrädchen über einen Seilzug mit Umlenkrolle oder mit Zahnrädchen anzutreiben. Keine Ahnung wie das Maschinchen aussieht, das du dir da baust.